Teadusnõukogu on loodud instituudi teadus- ja arendustegevusega seotud küsimuste lahendamiseks.
Nõukogu koosseisu kuuluvad instituudi teadurid, Maaeluministeeriumi esindajad, Eesti Maaülikooli teadlased, põllumajandustootjad ning valdkonnaga seotud erinevate ametite esindajad.
Siim Tiidemann
Maaeluministeeriumi kalanduspoliitika ja välissuhete asekantsler
Külli Annamaa
Geenipanga juhataja
Madis Ajaots
Eesti Põllumeeste Keskliidu esindaja
Kadri Järve
TTÜ Geenitehnoloogia Instituudi dotsent
Kalle Hamburg
Eestimaa Talupidajate Keskliidu juhatuse esimees
Marika Mänd
EMÜ Põllumajandus- ja keskkonnainstituudi professor
Anu Nemvalts
Põllumajandus- ja toiduameti peadirektori asetäitja taimetervise ja taimse paljundusmaterjali, maaparanduse ja maakasutuse ning taimekaitse ja väetiste valdkonnas (COPHS)
Pille Sooväli
Vanemteadur, taimekaitse osakonna juhataja
Kalvi Tamm
Vanemteadur, agrotehnoloogia osakonna juhataja
Ilmar Tamm
Vanemteadur, sordiaretuse osakonna juhataja
Tõnis Tänav
Maaeluministeeriumi teadus- ja arendusosakonna juhataja
Leho Verk
Maaelu Edendamise Sihtasutuse juhatuse liige
Aret Vooremäe
EMÜ Põllumajandus- ja keskkonnainstituudi direktor
Teadusnõukogu protokollid on avalikult kätte saadavad alates 2021. a jaanuarist.